Paprastai, procesus, kurią gyvųjų organizmų imtis deguonies ir anglies dioksidui pašalinti teikti energijos. Labiau formalaus, išsamus apibrėžimas yra įvairūs procesai, kuriuose yra organinių substratų, išvestų iš maisto produktų energijos, vartojamos energijos biocheminiams transformaciją, sintetinių ir transporto procesais, išorės darbą, ir, galų gale, šilumos. Šios pertvarkos, paprastai identifikuoti kaip metabolizmas, dažniausiai reikia, kad dalyvautų deguonies ir apima visą organinės anglies dvideginį bei vandenį (aerobinės kvėpavimo), skirta oksidacijos. Jei oksidacija yra neišsami, dėl organinių junginių kaip galutinių produktų, deguonies paprastai nedalyvauja ir procesas tada identifikuojama kaip anaerobinio kvėpavimo . Reikalaujama aerobinėmis sąlygomis kvėpavimo deguonies Galiausiai yra gautas iš atmosferos arba deguonies, ištirpinamas vandenyje. Keitimo procesą ir deguonies iš gyvūno aplinkos ir, ląstelėse parazituojančio transporto vietų, susijusių medžiagų apykaita, ir atvirkštinio transporto bei keitimasis galutinio produkto anglies dioksido, dažnai vadinamas kvėpavimas, nors ji yra tik dalis bendro proceso.